MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 2345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015561	GCG	2	6	46410	46415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917619
1002	NC_015561	ATT	2	6	46464	46469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333917619
1003	NC_015561	CTG	2	6	46476	46481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917619
1004	NC_015561	GGC	2	6	46514	46519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917619
1005	NC_015561	TGT	2	6	46522	46527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917619
1006	NC_015561	CGGG	2	8	46558	46565	0 %	0 %	75 %	25 %	333917619
1007	NC_015561	CTG	2	6	46593	46598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917619
1008	NC_015561	TGC	2	6	46615	46620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917619
1009	NC_015561	TGC	4	12	46682	46693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917619
1010	NC_015561	TGC	2	6	46712	46717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917619
1011	NC_015561	GGT	2	6	46743	46748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917619
1012	NC_015561	GCG	2	6	46752	46757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917619
1013	NC_015561	CGG	3	9	46781	46789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917619
1014	NC_015561	CCG	2	6	46827	46832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917619
1015	NC_015561	CCT	2	6	46836	46841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917619
1016	NC_015561	GGT	2	6	46845	46850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917619
1017	NC_015561	GGC	2	6	46851	46856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917619
1018	NC_015561	GGT	2	6	46857	46862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917619
1019	NC_015561	CTG	2	6	46867	46872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917619
1020	NC_015561	GGC	3	9	46887	46895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917619
1021	NC_015561	TGG	2	6	46913	46918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917619
1022	NC_015561	CGGG	2	8	46933	46940	0 %	0 %	75 %	25 %	333917619
1023	NC_015561	TGG	2	6	46949	46954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917619
1024	NC_015561	GGC	3	9	46962	46970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917619
1025	NC_015561	GTG	2	6	47023	47028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917619
1026	NC_015561	GC	4	8	47065	47072	0 %	0 %	50 %	50 %	333917619
1027	NC_015561	CGG	2	6	47100	47105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917619
1028	NC_015561	CGG	2	6	47134	47139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917620
1029	NC_015561	GTTT	2	8	47209	47216	0 %	75 %	25 %	0 %	333917620
1030	NC_015561	CGG	2	6	47263	47268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917620
1031	NC_015561	GCT	2	6	47269	47274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1032	NC_015561	CGC	2	6	47292	47297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917620
1033	NC_015561	GTG	2	6	47303	47308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917620
1034	NC_015561	ACG	2	6	47310	47315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1035	NC_015561	GCC	2	6	47367	47372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917620
1036	NC_015561	GCG	2	6	47373	47378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917620
1037	NC_015561	TCG	2	6	47460	47465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1038	NC_015561	GAT	2	6	47474	47479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917620
1039	NC_015561	GAT	2	6	47497	47502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917620
1040	NC_015561	CGA	2	6	47526	47531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1041	NC_015561	GCT	2	6	47611	47616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1042	NC_015561	CGC	2	6	47644	47649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917620
1043	NC_015561	TCG	2	6	47652	47657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1044	NC_015561	CGC	2	6	47730	47735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917620
1045	NC_015561	GCG	2	6	47781	47786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917620
1046	NC_015561	CAGA	2	8	47828	47835	50 %	0 %	25 %	25 %	333917620
1047	NC_015561	GCG	2	6	47839	47844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917620
1048	NC_015561	GCAG	2	8	47860	47867	25 %	0 %	50 %	25 %	333917620
1049	NC_015561	GTC	2	6	47877	47882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1050	NC_015561	CGG	2	6	47887	47892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917620
1051	NC_015561	GGC	2	6	47905	47910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917620
1052	NC_015561	CGC	2	6	47953	47958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917620
1053	NC_015561	GC	3	6	47985	47990	0 %	0 %	50 %	50 %	333917620
1054	NC_015561	GAG	2	6	48071	48076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917620
1055	NC_015561	CTG	2	6	48170	48175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1056	NC_015561	TATC	2	8	48214	48221	25 %	50 %	0 %	25 %	333917620
1057	NC_015561	CGGC	2	8	48231	48238	0 %	0 %	50 %	50 %	333917620
1058	NC_015561	GTC	2	6	48289	48294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1059	NC_015561	CG	3	6	48438	48443	0 %	0 %	50 %	50 %	333917620
1060	NC_015561	CGA	2	6	48445	48450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917620
1061	NC_015561	CGTG	2	8	48454	48461	0 %	25 %	50 %	25 %	333917620
1062	NC_015561	TC	3	6	48530	48535	0 %	50 %	0 %	50 %	333917620
1063	NC_015561	GGT	2	6	48595	48600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015561	GCA	2	6	48601	48606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015561	GAA	2	6	48624	48629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917621
1066	NC_015561	CAG	2	6	48633	48638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1067	NC_015561	GCAG	3	12	48645	48656	25 %	0 %	50 %	25 %	333917621
1068	NC_015561	GC	3	6	48665	48670	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
1069	NC_015561	TC	3	6	48696	48701	0 %	50 %	0 %	50 %	333917621
1070	NC_015561	CGA	2	6	48702	48707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1071	NC_015561	GC	4	8	48727	48734	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
1072	NC_015561	CCG	3	9	48792	48800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917621
1073	NC_015561	CG	3	6	48799	48804	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
1074	NC_015561	GGC	2	6	48807	48812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917621
1075	NC_015561	GGT	2	6	48909	48914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917621
1076	NC_015561	TCA	2	6	49094	49099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917621
1077	NC_015561	GCT	2	6	49128	49133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1078	NC_015561	GCGT	2	8	49166	49173	0 %	25 %	50 %	25 %	333917621
1079	NC_015561	TCAA	2	8	49264	49271	50 %	25 %	0 %	25 %	333917621
1080	NC_015561	CAGA	2	8	49375	49382	50 %	0 %	25 %	25 %	333917621
1081	NC_015561	TGG	2	6	49412	49417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917621
1082	NC_015561	AACA	2	8	49463	49470	75 %	0 %	0 %	25 %	333917621
1083	NC_015561	GCT	2	6	49491	49496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1084	NC_015561	CGCC	2	8	49502	49509	0 %	0 %	25 %	75 %	333917621
1085	NC_015561	GGC	2	6	49516	49521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917621
1086	NC_015561	TCTGA	2	10	49555	49564	20 %	40 %	20 %	20 %	333917621
1087	NC_015561	AAC	2	6	49576	49581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917621
1088	NC_015561	GAG	2	6	49588	49593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917621
1089	NC_015561	GAG	2	6	49624	49629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917621
1090	NC_015561	GCT	2	6	49650	49655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1091	NC_015561	GC	4	8	49665	49672	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
1092	NC_015561	GTC	2	6	49758	49763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1093	NC_015561	TCCC	2	8	49766	49773	0 %	25 %	0 %	75 %	333917621
1094	NC_015561	TGA	2	6	49776	49781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917621
1095	NC_015561	GC	3	6	49788	49793	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
1096	NC_015561	GCT	2	6	49800	49805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1097	NC_015561	GGCT	2	8	49806	49813	0 %	25 %	50 %	25 %	333917621
1098	NC_015561	GCC	2	6	49840	49845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917621
1099	NC_015561	CGT	2	6	49890	49895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1100	NC_015561	TCA	2	6	49916	49921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917621
1101	NC_015561	ATG	2	6	49933	49938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917621
1102	NC_015561	GT	3	6	49973	49978	0 %	50 %	50 %	0 %	333917621
1103	NC_015561	GAA	2	6	50023	50028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917621
1104	NC_015561	GC	3	6	50033	50038	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
1105	NC_015561	ATC	2	6	50068	50073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917621
1106	NC_015561	CG	3	6	50084	50089	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
1107	NC_015561	CGA	2	6	50160	50165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1108	NC_015561	ACG	2	6	50222	50227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917621
1109	NC_015561	GCC	2	6	50257	50262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917621
1110	NC_015561	GCC	3	9	50297	50305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917621
1111	NC_015561	CCT	2	6	50471	50476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917622
1112	NC_015561	GCA	2	6	50547	50552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917622
1113	NC_015561	CGG	2	6	50622	50627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917622
1114	NC_015561	GATC	2	8	50651	50658	25 %	25 %	25 %	25 %	333917622
1115	NC_015561	GC	3	6	50660	50665	0 %	0 %	50 %	50 %	333917622
1116	NC_015561	GCC	2	6	50676	50681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917622
1117	NC_015561	CGC	2	6	50694	50699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917622
1118	NC_015561	GCA	3	9	50702	50710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917622
1119	NC_015561	TCG	2	6	50748	50753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917623
1120	NC_015561	GCT	3	9	50779	50787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917623
1121	NC_015561	GAA	2	6	50819	50824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917623
1122	NC_015561	CGC	2	6	50830	50835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917623
1123	NC_015561	GAT	2	6	50860	50865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917623
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1125	NC_015561	TCA	2	6	50907	50912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917623
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1247	NC_015561	T	6	6	55821	55826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_015561	CAG	2	6	55884	55889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1251	NC_015561	CTT	2	6	56056	56061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917628
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1260	NC_015561	TA	3	6	56648	56653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1377	NC_015561	GGT	2	6	60748	60753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917631
1378	NC_015561	CTT	2	6	60786	60791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917631
1379	NC_015561	GC	3	6	60800	60805	0 %	0 %	50 %	50 %	333917631
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1381	NC_015561	GCG	2	6	60830	60835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917631
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1383	NC_015561	TCG	2	6	60953	60958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917631
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1464	NC_015561	GGT	2	6	64053	64058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1493	NC_015561	GC	3	6	64891	64896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1494	NC_015561	TGG	2	6	64933	64938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1495	NC_015561	TG	4	8	64989	64996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1496	NC_015561	CGGG	2	8	64997	65004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1497	NC_015561	TGT	2	6	65011	65016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1498	NC_015561	GC	3	6	65134	65139	0 %	0 %	50 %	50 %	333917635
1499	NC_015561	ATC	2	6	65199	65204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917635
1500	NC_015561	GTT	2	6	65209	65214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917635

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